Ο Βαγγέλης Παπαθανασίου έλαβε πλήθος διακρίσεων εκ των οποίων οι σημαντικότερες ήταν το 1995, όταν ως φόρο τιμής στην μουσική του διαδρομή αλλά και στην λατρεία του για την Αστρονομία και την Διαστημική, το Minor Planet Center της Διεθνούς Αστρονομικής Ενώσεως έδωσε το όνομα του συνθέτη στον Αστεροειδή της Κύριας Ζώνης 6354, που πλέον ονομάζεται «6354 Vangelis». Επίσης σημαίνουαα διάκριση ήταν το 2003, όταν η NASA του απένειμε το μετάλλιο δημόσιας συνεισφοράς ως αναγνώριση της συμβολής του στο όραμά της. Το βραβείο συνιστά την υψηλότερη τιμή από τον Αμερικανικό Οργανισμό για μη κυβερνητικά πρόσωπα.